More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2490 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2490  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 324 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3895  AraC family transcriptional regulator  92.9 
 
 		 324 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.155273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5068  AraC family transcriptional regulator  87.04 
 
 		 324 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463601  normal  0.326617 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5361  AraC family transcriptional regulator  94.1 
 
 		 324 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835792  normal  0.535982 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3531  AraC family transcriptional regulator  94.41 
 
 		 324 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.342116 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3625  AraC family transcriptional regulator  93.83 
 
 		 324 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4738  AraC family transcriptional regulator  92.77 
 
 		 290 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344655  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0335  AraC family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 355 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 330 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  33.88 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1533  helix-turn-helix domain-containing protein  29.57 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  29.07 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  29.14 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 355 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 392 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 355 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 355 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 352 aa  106  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 368 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 341 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  28.87 
 
 		 326 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 327 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 318 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28.88 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  32.2 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 		 341 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 343 aa  92.8  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  30.33 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  38.97 
 
 		 338 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 316 aa  89.4  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  27.56 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6280  AraC/XylS family transcription factor  31.02 
 
 		 347 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  26.67 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  40.16 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0570  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3631  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.74 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  26.49 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.81 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  27.31 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  28.8 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  24.33 
 
 		 340 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  26.51 
 
 		 358 aa  72.8  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  36.22 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2378  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1125  AraC family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  27.42 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  40.4 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  33.82 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  35.87 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  36.36 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1874  AraC family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 341 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.612156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1825  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>