60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4738 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4738  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3625  AraC family transcriptional regulator  98.39 
 
 		 324 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3895  AraC family transcriptional regulator  99.15 
 
 		 324 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.155273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2490  AraC family transcriptional regulator  92.67 
 
 		 324 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5361  AraC family transcriptional regulator  89.66 
 
 		 324 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835792  normal  0.535982 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3531  AraC family transcriptional regulator  89.66 
 
 		 324 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.342116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5068  AraC family transcriptional regulator  83.47 
 
 		 324 aa  391  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463601  normal  0.326617 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0335  AraC family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  33.94 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1533  helix-turn-helix domain-containing protein  27.07 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 341 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 355 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  27.16 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6280  AraC/XylS family transcription factor  32.55 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  28.96 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 368 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  31.35 
 
 		 340 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  25.7 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  25.78 
 
 		 327 aa  53.5  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0570  transcriptional regulator, AraC family  24.03 
 
 		 325 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  27.64 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  24.53 
 
 		 326 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  27.13 
 
 		 341 aa  49.3  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  25.75 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  30.63 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 321 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 319 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  23.83 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  25.36 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  24.02 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 369 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 369 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 332 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 369 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1825  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 344 aa  42.7  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>