More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3895 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3895  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 324 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.155273 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3625  AraC family transcriptional regulator  99.07 
 
 		 324 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2490  AraC family transcriptional regulator  92.9 
 
 		 324 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5068  AraC family transcriptional regulator  84.57 
 
 		 324 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463601  normal  0.326617 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3531  AraC family transcriptional regulator  90.99 
 
 		 324 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.342116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5361  AraC family transcriptional regulator  90.99 
 
 		 324 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835792  normal  0.535982 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4738  AraC family transcriptional regulator  99.15 
 
 		 290 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344655  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0335  AraC family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 355 aa  322  4e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  34.64 
 
 		 342 aa  149  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1533  helix-turn-helix domain-containing protein  30.69 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 328 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 355 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 355 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 341 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 355 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 341 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  32.21 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  29.79 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 368 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  29.08 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  30.75 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  33.44 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 326 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  29.06 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  29.71 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  27.78 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6280  AraC/XylS family transcription factor  32.3 
 
 		 347 aa  89.4  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28.8 
 
 		 338 aa  89.4  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  27.71 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 343 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 336 aa  87  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0570  transcriptional regulator, AraC family  26.37 
 
 		 325 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 319 aa  86.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 329 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3631  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.1 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  29.21 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  26.28 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  28.17 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  27.85 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  27.95 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.48 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  27.57 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  34.27 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  36.76 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  34.27 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2378  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1874  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.612156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  24.23 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  29.51 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  38.04 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  41.41 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2306  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  27.54 
 
 		 358 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4759  transcriptional regulator, AraC family  26.23 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1825  AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0629  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 		 354 aa  65.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>