More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4778 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 340 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  71.76 
 
 		 339 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 		 338 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  39.5 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 343 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  29.65 
 
 		 339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  35.96 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1874  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.612156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  31.54 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  28.21 
 
 		 342 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  30.38 
 
 		 333 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  32.44 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.45 
 
 		 338 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  30.8 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  37.79 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  26.76 
 
 		 362 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 337 aa  109  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 341 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 355 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3631  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.77 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  26.2 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2378  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 327 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 336 aa  99.4  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.29 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 327 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  39.22 
 
 		 326 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  27.22 
 
 		 321 aa  95.9  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  49 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  49 
 
 		 389 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  49 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  49 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  49 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  43.81 
 
 		 118 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  49 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  49 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  38.73 
 
 		 340 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 321 aa  92.8  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  35.77 
 
 		 327 aa  92.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  40.98 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  25.9 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 327 aa  90.1  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0335  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 355 aa  90.1  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 330 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6280  AraC/XylS family transcription factor  26.13 
 
 		 347 aa  89.7  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 		 327 aa  89.7  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 392 aa  89.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  33.57 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1125  AraC family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0336  helix-turn-helix domain-containing protein  30.08 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  28.21 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5068  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463601  normal  0.326617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1825  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 320 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 329 aa  86.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 		 334 aa  85.9  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0594  helix-turn-helix domain-containing protein  35.37 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  42.31 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  39.81 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  34.75 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0600  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2706  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062854  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3895  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.155273 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0639  transcriptional regulator, AraC family  45.36 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>