More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5084 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 343 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  78.17 
 
 		 339 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  46.95 
 
 		 329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  46.67 
 
 		 338 aa  325  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  46.95 
 
 		 329 aa  315  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  44.12 
 
 		 332 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  43.99 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 339 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  31.39 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  32.93 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2378  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 352 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  30.2 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 327 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 321 aa  92.8  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 389 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  47.47 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 		 322 aa  90.1  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  49.54 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 341 aa  89.7  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 321 aa  89.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 368 aa  89.4  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1874  AraC family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 341 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.612156 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 319 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 319 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 319 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  29.6 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  32.73 
 
 		 198 aa  86.7  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 330 aa  86.3  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  45.37 
 
 		 321 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0570  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 325 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  40 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.66 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  32.73 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  35.26 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  28.27 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  30.46 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1825  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  27.68 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  29.94 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  41.41 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.63 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4759  transcriptional regulator, AraC family  28.64 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  41.51 
 
 		 118 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  38.46 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  38.46 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  38.46 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  38.46 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3895  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 324 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.155273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  37.5 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.5 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  37.5 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  37.5 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  37.5 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  37.5 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  37.5 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  41.51 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  37.5 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2821  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  37.5 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4516  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  36.94 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000715  ethanolamine operon regulatory protein  36.63 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2924  AraC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817827  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  32.05 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>