More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3625 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3625  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 324 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3895  AraC family transcriptional regulator  99.07 
 
 		 324 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.155273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2490  AraC family transcriptional regulator  93.83 
 
 		 324 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5068  AraC family transcriptional regulator  85.49 
 
 		 324 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463601  normal  0.326617 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5361  AraC family transcriptional regulator  91.93 
 
 		 324 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835792  normal  0.535982 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3531  AraC family transcriptional regulator  91.93 
 
 		 324 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.342116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4738  AraC family transcriptional regulator  98.39 
 
 		 290 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344655  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0335  AraC family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 355 aa  322  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  34.64 
 
 		 342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1533  helix-turn-helix domain-containing protein  30.69 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 330 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 328 aa  126  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 329 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  28.53 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 355 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 355 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 341 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 355 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  32.55 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  29.79 
 
 		 326 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 368 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  30.06 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  33.44 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 326 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 327 aa  95.9  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  29.38 
 
 		 341 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  30.03 
 
 		 327 aa  93.6  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  29.45 
 
 		 338 aa  93.2  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 329 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6280  AraC/XylS family transcription factor  32.65 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  28.11 
 
 		 329 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  27.47 
 
 		 321 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 319 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0570  transcriptional regulator, AraC family  26.3 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 329 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 319 aa  85.9  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  30.6 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  26.28 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3631  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.66 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  28.17 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  28.74 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  27.94 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.67 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  34.27 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  36.76 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  27.02 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  34.27 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  30.21 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2378  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  28.8 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1874  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.612156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0629  transcriptional regulator, AraC family  29.23 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  41.41 
 
 		 405 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 389 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  36.96 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  27.9 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  24.43 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1825  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2306  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>