More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1722 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 369 aa  753    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 332 aa  679    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  98.37 
 
 		 369 aa  740    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 369 aa  753    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 369 aa  753    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 329 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.1 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1825  AraC family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 344 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  31.55 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  31.39 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 392 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3631  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.32 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  30.23 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.73 
 
 		 314 aa  140  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 368 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  29.94 
 
 		 326 aa  136  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  32.44 
 
 		 322 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  32.11 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 330 aa  129  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 327 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  29.84 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 355 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 341 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  29.84 
 
 		 341 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1533  helix-turn-helix domain-containing protein  27.38 
 
 		 330 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655732 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 335 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  29.64 
 
 		 434 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 330 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6280  AraC/XylS family transcription factor  29.15 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2378  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  26.94 
 
 		 340 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  26.44 
 
 		 327 aa  97.1  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  26.28 
 
 		 321 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  29.33 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 319 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  39.32 
 
 		 118 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 321 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 326 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  28.74 
 
 		 339 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 321 aa  92.8  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 319 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0639  transcriptional regulator, AraC family  28.09 
 
 		 350 aa  90.5  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 329 aa  89.7  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1874  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 341 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.612156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  30.53 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 131 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 131 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 131 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3159  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 318 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  40.87 
 
 		 331 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  31.91 
 
 		 198 aa  86.3  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4430  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330528  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4344  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4724  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  35.71 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0336  helix-turn-helix domain-containing protein  28.26 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3100  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  29.82 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32060  transcriptional regulator XylS  27.53 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  33.56 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  25.08 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2689  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 318 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2706  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062854  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5068  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463601  normal  0.326617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  34.06 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0629  transcriptional regulator, AraC family  27.21 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>