More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4191 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 336 aa  694    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  34.55 
 
 		 340 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  30.9 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4759  transcriptional regulator, AraC family  31.17 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  38.65 
 
 		 333 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  29.93 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  37.68 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  27.42 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 316 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  30.16 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  41.91 
 
 		 334 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  34.88 
 
 		 330 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 341 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0570  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 392 aa  99.8  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 321 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 355 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  30.16 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  30.74 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 334 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 355 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 355 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 352 aa  96.3  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 341 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  28.96 
 
 		 339 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 338 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 329 aa  92.4  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 327 aa  92.4  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 336 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1874  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.612156 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 368 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2464  helix-turn-helix, AraC type  30.67 
 
 		 329 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.903798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  28.11 
 
 		 335 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2378  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  40.91 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  34.3 
 
 		 333 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2689  AraC family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  42.15 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2984  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0543899 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5068  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463601  normal  0.326617 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3995  helix-turn-helix domain-containing protein  31.47 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2306  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  43.14 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  35.25 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3100  transcriptional regulator, AraC family  25.08 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  42.45 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1533  helix-turn-helix domain-containing protein  26.27 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655732 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1825  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  42.22 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2718  transcriptional regulator XylS  26.28 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  37.68 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  36.96 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  36.91 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3895  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.155273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2316  transcriptional regulator, AraC family  40.17 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.31305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4895  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.675745  normal  0.259797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0335  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0629  transcriptional regulator, AraC family  41.75 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>