More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2316 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2316  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 336 aa  688    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.31305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 349 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 335 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  39.42 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2624  helix-turn-helix domain-containing protein  34.13 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0150  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4177  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128864  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  43.14 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  42.99 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2651  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0391115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 118 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  36.43 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1113  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.478507 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2987  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.229756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  41.44 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000715  ethanolamine operon regulatory protein  30.12 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2976  transcriptional regulator, AraC family  34.71 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  35.35 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  43.56 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  34.62 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  34.34 
 
 		 350 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  32.71 
 
 		 350 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  34.34 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  34.34 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  34.34 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  34.34 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.34 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  34.34 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  34.34 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  34.34 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3248  HTH-type transcriptional regulator eutR  36.46 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869931  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  34.34 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5246  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251899  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2718  transcriptional regulator XylS  27.95 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  33.33 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1094  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2306  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  29.94 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0963  transcriptional regulator EutR  35.19 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  36.63 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6668  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  32.04 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0594  helix-turn-helix domain-containing protein  28.51 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>