More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2987 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2987  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 367 aa  757    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.229756  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1094  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3579  AraC family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2976  transcriptional regulator, AraC family  33.95 
 
 		 345 aa  86.3  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  42.2 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  41.28 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  41.28 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  41.28 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  41.28 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  31.02 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  21.72 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.37 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  40.37 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  40.57 
 
 		 350 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  40.57 
 
 		 350 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0600  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  40.37 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  40.37 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  40.57 
 
 		 350 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4473  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  39.62 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  39.62 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  32.84 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1533  putative ethanolamine operon transcriptional regulator  44.23 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.56366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1361  AraC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 312 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2470  AraC family transcription regulator  44.23 
 
 		 312 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0288941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 327 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0344  AraC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 312 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.7264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1278  AraC family transcription regulator  44.23 
 
 		 339 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834971  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0947  AraC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 312 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0977731  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1205  AraC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 339 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0624  AraC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 312 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79157  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4998  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5221  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3304  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2415  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.458311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5063  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0594  helix-turn-helix domain-containing protein  24.84 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0150  AraC family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  35.65 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  38.02 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5246  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251899  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  33.52 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0963  transcriptional regulator EutR  38.32 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 319 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5197  AraC family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 319 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4772  AraC family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3248  HTH-type transcriptional regulator eutR  43.56 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869931  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5506  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3590  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  35.2 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4777  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2316  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.31305 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0937  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4684  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4160  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  24.69 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3824  AraC family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347753 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2624  helix-turn-helix domain-containing protein  36.79 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000715  ethanolamine operon regulatory protein  41.41 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4072  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 341 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0275  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  30.77 
 
 		 351 aa  67  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  29.8 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4006  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  39.81 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>