More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5063 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5221  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 320 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3304  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 320 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5063  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 320 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4473  AraC family transcriptional regulator  89.69 
 
 		 320 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4998  AraC family transcriptional regulator  89.62 
 
 		 318 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0600  AraC family transcriptional regulator  81.88 
 
 		 320 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3579  AraC family transcriptional regulator  77.99 
 
 		 319 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  68.05 
 
 		 320 aa  431  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5506  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 312 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4777  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 332 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3590  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 332 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1361  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0624  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2470  AraC family transcription regulator  35.37 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0288941  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0947  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0977731  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0344  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.7264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1278  AraC family transcription regulator  35.37 
 
 		 339 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834971  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1205  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 339 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0937  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1533  putative ethanolamine operon transcriptional regulator  34.73 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.56366  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4684  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 312 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4160  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 312 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3824  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 334 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347753 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6712  AraC family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6477  AraC family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  32.78 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2976  transcriptional regulator, AraC family  30.52 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.85 
 
 		 350 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 350 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  28.85 
 
 		 350 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  28.21 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  28.85 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  29.39 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  28.21 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  28.21 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  28.21 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  28.85 
 
 		 350 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  28.85 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 373 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  28.21 
 
 		 350 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  28.39 
 
 		 350 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  28.21 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0150  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 344 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2415  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.458311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0963  transcriptional regulator EutR  28.35 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 341 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  30.42 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3248  HTH-type transcriptional regulator eutR  34.41 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869931  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4006  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  34.41 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3935  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  34.41 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2987  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0135  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1550  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  34.41 
 
 		 342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3052  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  34.41 
 
 		 342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.680184  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3318  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  34.41 
 
 		 342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2624  helix-turn-helix domain-containing protein  31.11 
 
 		 347 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3360  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 330 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5197  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000715  ethanolamine operon regulatory protein  26.5 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4772  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  26.56 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0275  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  25.47 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1113  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.478507 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4072  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368095  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5246  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251899  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2651  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0391115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2706  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062854  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3149  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 349 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2565  helix-turn-helix domain-containing protein  26.21 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  35.94 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2987  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.229756  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  37.86 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>