More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0105 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 319 aa  659    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3159  AraC family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3100  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2689  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  31.67 
 
 		 319 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2718  transcriptional regulator XylS  30.72 
 
 		 328 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32060  transcriptional regulator XylS  32.48 
 
 		 318 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  26.33 
 
 		 342 aa  96.3  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  24.84 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  25.5 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  25.28 
 
 		 333 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 355 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  25.95 
 
 		 341 aa  86.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 341 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 341 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  28.91 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1533  helix-turn-helix domain-containing protein  26.52 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655732 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  25.22 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  36.89 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  32.64 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  34.33 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  25.37 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1125  AraC family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.01 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  33.93 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  26.34 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0629  transcriptional regulator, AraC family  25.53 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2464  helix-turn-helix, AraC type  24.08 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.903798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  26.9 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  31.3 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  28.78 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0570  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4177  helix-turn-helix domain-containing protein  26.17 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128864  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2984  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0543899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  36.97 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 369 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 369 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  30.43 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4516  AraC family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 369 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  30.43 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.43 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2624  helix-turn-helix domain-containing protein  27.35 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  30.43 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  30.43 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  23.4 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  30.43 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3995  helix-turn-helix domain-containing protein  30.1 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  33.93 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4759  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  30.43 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3824  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  22.06 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1094  AraC family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>