More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2809 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  98.57 
 
 		 350 aa  723    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  98.57 
 
 		 350 aa  723    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  90.86 
 
 		 350 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  98.29 
 
 		 350 aa  721    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  98.86 
 
 		 350 aa  725    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  91.43 
 
 		 350 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  91.14 
 
 		 350 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  91.43 
 
 		 350 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  99.14 
 
 		 350 aa  726    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  98.57 
 
 		 350 aa  723    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  100 
 
 		 350 aa  731    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  91.43 
 
 		 350 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  99.43 
 
 		 350 aa  728    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  99.43 
 
 		 350 aa  728    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0963  transcriptional regulator EutR  56.2 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2624  helix-turn-helix domain-containing protein  40.55 
 
 		 347 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  39.41 
 
 		 349 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 344 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 338 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0150  AraC family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 338 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  36.89 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4006  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  38.26 
 
 		 342 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2987  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3318  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  39.81 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0135  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3052  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  39.81 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.680184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1550  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  39.81 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3935  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  39.81 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3248  HTH-type transcriptional regulator eutR  39.35 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869931  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4684  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 312 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4160  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 312 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0937  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5506  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3590  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4777  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1533  putative ethanolamine operon transcriptional regulator  33.97 
 
 		 312 aa  169  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.56366  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3824  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 334 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1361  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0947  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0977731  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2470  AraC family transcription regulator  34.19 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0288941  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1278  AraC family transcription regulator  34.19 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834971  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0624  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79157  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1205  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0344  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.7264  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  33.55 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2415  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.458311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4772  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 345 aa  150  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  29.25 
 
 		 322 aa  146  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 335 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4473  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4998  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1113  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.478507 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000715  ethanolamine operon regulatory protein  30.43 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5063  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3304  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5221  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0275  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  27.16 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0600  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 320 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2976  transcriptional regulator, AraC family  29.97 
 
 		 345 aa  132  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6477  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6712  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3579  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5246  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251899  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 302 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3149  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2565  helix-turn-helix domain-containing protein  27.62 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4072  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3360  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 334 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2706  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 299 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062854  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2651  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 318 aa  104  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0391115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5197  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 330 aa  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 327 aa  99.4  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2987  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.229756  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  42.72 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  37.74 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>