More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3935 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3935  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  100 
 
 
342 aa  685    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2987  AraC family transcriptional regulator  99.71 
 
 
342 aa  683    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0135  AraC family transcriptional regulator  99.71 
 
 
342 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3248  HTH-type transcriptional regulator eutR  96.78 
 
 
342 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3318  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  99.71 
 
 
342 aa  683    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1550  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  99.71 
 
 
342 aa  683    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4006  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  99.42 
 
 
342 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3052  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  99.71 
 
 
342 aa  683    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.680184  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  78.57 
 
 
351 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0150  AraC family transcriptional regulator  78.57 
 
 
338 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  78.57 
 
 
351 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  77.08 
 
 
344 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  77.91 
 
 
343 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  78.25 
 
 
344 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  77.34 
 
 
344 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  66.46 
 
 
349 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  67.74 
 
 
352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  60.63 
 
 
338 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2624  helix-turn-helix domain-containing protein  48.78 
 
 
347 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  48.22 
 
 
330 aa  255  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  40.62 
 
 
324 aa  219  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  40.76 
 
 
350 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  40.76 
 
 
350 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  40.45 
 
 
350 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  40.45 
 
 
350 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  40.45 
 
 
350 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  38.59 
 
 
350 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.59 
 
 
350 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  38.59 
 
 
350 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  38.26 
 
 
350 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  38.26 
 
 
350 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  38.59 
 
 
350 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  40.51 
 
 
350 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  38.59 
 
 
350 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0963  transcriptional regulator EutR  38.92 
 
 
347 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  39.81 
 
 
350 aa  205  7e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2415  AraC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
328 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.458311  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  35.81 
 
 
327 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0275  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  32.91 
 
 
351 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  36.13 
 
 
373 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000715  ethanolamine operon regulatory protein  32.82 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1113  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 
325 aa  159  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.478507 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
335 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
335 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
335 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5197  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
332 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  32.17 
 
 
322 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
334 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3360  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 
334 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 
342 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 
341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
337 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 
339 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3579  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 
319 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0600  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 
320 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4998  AraC family transcriptional regulator  36.22 
 
 
318 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681619  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4473  AraC family transcriptional regulator  36.22 
 
 
320 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5221  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 
320 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3304  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 
320 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5063  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 
320 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2976  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 
345 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4772  AraC family transcriptional regulator  37.43 
 
 
345 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5246  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251899  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 
321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1533  putative ethanolamine operon transcriptional regulator  33.55 
 
 
312 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.56366  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2651  AraC family transcriptional regulator  31.61 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0391115  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0344  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.7264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1361  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2470  AraC family transcription regulator  33.22 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0288941  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0624  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79157  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0947  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0977731  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1205  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 
339 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1278  AraC family transcription regulator  33.22 
 
 
339 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834971  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4684  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
312 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4160  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
312 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301949  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5506  AraC family transcriptional regulator  32.25 
 
 
312 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3590  AraC family transcriptional regulator  32.25 
 
 
332 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4777  AraC family transcriptional regulator  32.25 
 
 
332 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3824  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000347753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0937  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4072  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 
330 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  26.62 
 
 
319 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6712  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 
314 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6477  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 
314 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2706  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 
299 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062854  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 
302 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3149  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2565  helix-turn-helix domain-containing protein  26.47 
 
 
299 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  41.8 
 
 
327 aa  92.8  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  39.07 
 
 
322 aa  86.7  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  35.53 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 
330 aa  82.4  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  43.88 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  35.25 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>