More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0624 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1361  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
312 aa  634    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0947  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
312 aa  634    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0977731  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2470  AraC family transcription regulator  100 
 
 
312 aa  634    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0288941  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1278  AraC family transcription regulator  100 
 
 
339 aa  634    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834971  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1205  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
339 aa  634    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0624  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
312 aa  634    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79157  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0344  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
312 aa  634    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.7264  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1533  putative ethanolamine operon transcriptional regulator  95.19 
 
 
312 aa  608  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.56366  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0937  AraC family transcriptional regulator  83.55 
 
 
314 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4160  AraC family transcriptional regulator  84.84 
 
 
312 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301949  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4684  AraC family transcriptional regulator  84.84 
 
 
312 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3824  AraC family transcriptional regulator  79.82 
 
 
334 aa  518  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000347753 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5506  AraC family transcriptional regulator  83.55 
 
 
312 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4777  AraC family transcriptional regulator  83.55 
 
 
332 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3590  AraC family transcriptional regulator  83.55 
 
 
332 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5063  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
320 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5221  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
320 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3304  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 
320 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  36.64 
 
 
320 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3579  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 
319 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4998  AraC family transcriptional regulator  34.54 
 
 
318 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681619  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4473  AraC family transcriptional regulator  34.54 
 
 
320 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0600  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.5 
 
 
350 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  34.5 
 
 
350 aa  169  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  34.5 
 
 
350 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  34.82 
 
 
350 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  34.19 
 
 
350 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  34.52 
 
 
327 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  34.5 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  34.5 
 
 
350 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  34.5 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  34.19 
 
 
350 aa  165  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  33.33 
 
 
350 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  33.33 
 
 
350 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  33.33 
 
 
350 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  33.33 
 
 
350 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  33.33 
 
 
350 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6712  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 
314 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6477  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 
314 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2976  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 
345 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0963  transcriptional regulator EutR  30.5 
 
 
347 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 
335 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 
335 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4072  AraC family transcriptional regulator  35.03 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368095  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
335 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  32.9 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  32.37 
 
 
373 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 
342 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 
338 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
352 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  28.05 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  32.9 
 
 
349 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 
344 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 
344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  29.62 
 
 
324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
351 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
351 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0150  AraC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000715  ethanolamine operon regulatory protein  28.85 
 
 
354 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 
337 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3248  HTH-type transcriptional regulator eutR  33.33 
 
 
342 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869931  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  34.64 
 
 
344 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2651  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 
318 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0391115  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 
339 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 
343 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4006  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  33.88 
 
 
342 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3318  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  33.55 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2415  AraC family transcriptional regulator  32.79 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.458311  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2987  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1550  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  33.55 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0135  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3052  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  33.55 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.680184  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3935  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  33.22 
 
 
342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5197  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
334 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5246  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251899  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2624  helix-turn-helix domain-containing protein  29.87 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  30.35 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3360  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 
334 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1113  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 
325 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.478507 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 
330 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0275  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  25.39 
 
 
351 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 
302 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  25.64 
 
 
319 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4772  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 
345 aa  99.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2565  helix-turn-helix domain-containing protein  29.58 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3149  AraC family transcriptional regulator  30.26 
 
 
349 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2706  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 
299 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062854  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
330 aa  89  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2611  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2987  AraC family transcriptional regulator  44.23 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.229756  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  37.8 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0998154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>