More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2982 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  679    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  61.35 
 
 		 330 aa  438  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0600  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 335 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 335 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 335 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  29.65 
 
 		 322 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  28.98 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  27.1 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  27.1 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  27.1 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  27.1 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  27.1 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5221  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3304  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5063  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  25.57 
 
 		 350 aa  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 334 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2976  transcriptional regulator, AraC family  25.67 
 
 		 345 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  27.85 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  25.79 
 
 		 350 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  25.24 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  25.24 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.79 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  25.79 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  25.79 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3579  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3149  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 349 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0275  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  26.52 
 
 		 351 aa  99.4  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  24.92 
 
 		 350 aa  99.4  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2565  helix-turn-helix domain-containing protein  27.79 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  39.66 
 
 		 338 aa  99.4  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  26.1 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2651  AraC family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 318 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0391115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4473  AraC family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4998  AraC family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2624  helix-turn-helix domain-containing protein  25.96 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2706  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062854  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1113  AraC family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.478507 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3360  AraC family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 334 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4684  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 312 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4160  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 312 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0963  transcriptional regulator EutR  26.53 
 
 		 347 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4777  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5506  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3590  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6477  AraC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6712  AraC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5197  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 332 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3248  HTH-type transcriptional regulator eutR  47.96 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0937  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 314 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2415  AraC family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.458311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5246  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 348 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251899  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3824  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  44.12 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1361  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0947  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0977731  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2470  AraC family transcription regulator  26.35 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0288941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0344  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.7264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0624  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79157  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  44.76 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1205  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 339 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1278  AraC family transcription regulator  25.16 
 
 		 339 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834971  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 368 aa  89.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 343 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  41.75 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0150  AraC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 339 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 344 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 339 aa  86.3  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2987  AraC family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0135  AraC family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3052  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  40.98 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.680184  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3318  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  40.98 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3935  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  40.98 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1550  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  40.98 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4006  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  40.98 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1533  putative ethanolamine operon transcriptional regulator  31.21 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.56366  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000715  ethanolamine operon regulatory protein  23.4 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4772  AraC family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  36.27 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>