More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1789 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 392 aa  787    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 329 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  38.44 
 
 		 342 aa  211  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 355 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 355 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 355 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 327 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 341 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 368 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6280  AraC/XylS family transcription factor  38.86 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 330 aa  173  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  34.82 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  30.25 
 
 		 369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 316 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  31.71 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  31.9 
 
 		 322 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  35.95 
 
 		 329 aa  137  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 321 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 352 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 362 aa  136  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.4 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  33.13 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 319 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 330 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  30.33 
 
 		 321 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 321 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 321 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  31.01 
 
 		 340 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 343 aa  123  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0629  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  31.56 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  28.91 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  31.56 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  31.02 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0639  transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 326 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5068  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463601  normal  0.326617 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  26.43 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1125  AraC family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 330 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  31.64 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 327 aa  103  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 336 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  32.03 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4759  transcriptional regulator, AraC family  30.47 
 
 		 332 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3895  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.155273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  28.3 
 
 		 358 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1825  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0335  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 355 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1533  helix-turn-helix domain-containing protein  25.33 
 
 		 330 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2976  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  29.81 
 
 		 318 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1113  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 325 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.478507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 		 322 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4516  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3625  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 324 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2378  AraC family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 321 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3159  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 318 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3531  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 324 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.342116 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 338 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  34.01 
 
 		 322 aa  90.5  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 		 334 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  42.2 
 
 		 373 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 318 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0570  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 325 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  42.11 
 
 		 329 aa  89.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2490  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2464  helix-turn-helix, AraC type  25.76 
 
 		 329 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.903798 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5361  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835792  normal  0.535982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  41.07 
 
 		 332 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  36.07 
 
 		 198 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 324 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2689  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  40.35 
 
 		 329 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>