More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1094 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1094  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 374 aa  750    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2987  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.229756  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2624  helix-turn-helix domain-containing protein  29.8 
 
 		 347 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 319 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  33.87 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  33.87 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  33.87 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  38.53 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  29.9 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  39.77 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  39.77 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  39.77 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 321 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  39.77 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  33.33 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  33.33 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0150  AraC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  38.64 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  44.21 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.64 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  38.64 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  38.64 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  38.64 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  42.39 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0594  helix-turn-helix domain-containing protein  25.32 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  26.52 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  42.7 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 335 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 324 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 351 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 351 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0963  transcriptional regulator EutR  36.67 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 336 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000715  ethanolamine operon regulatory protein  32.35 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2415  AraC family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.458311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3248  HTH-type transcriptional regulator eutR  42.7 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869931  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2689  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  39.62 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2976  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  40.23 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  39.05 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4684  AraC family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3360  AraC family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4160  AraC family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5197  AraC family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4772  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  37.38 
 
 		 118 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0737  helix-turn-helix domain-containing protein  31.47 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.396346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 		 333 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0937  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4006  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  33.33 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3824  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5246  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251899  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2026  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4177  helix-turn-helix domain-containing protein  44.21 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128864  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 333 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2987  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2316  transcriptional regulator, AraC family  34.82 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.31305 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0135  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3318  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  32.68 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1550  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  32.68 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3052  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  32.68 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.680184  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3935  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  32.68 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  30.94 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5506  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4777  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3590  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  35.54 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>