More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0594 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0594  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  655    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  40.95 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  24.35 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  34.13 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  34.94 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  39.47 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 118 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2987  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.229756  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  26.72 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  26.72 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  26.72 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  29.38 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  26.29 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  36.79 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  30.89 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  29.38 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  29.38 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  26.29 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1094  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  36.61 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  38.32 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  30.89 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  26.13 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  34.29 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.75 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  28.75 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  28.75 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3995  helix-turn-helix domain-containing protein  25.89 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3579  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3824  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  42.45 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2976  transcriptional regulator, AraC family  34.51 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2651  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0391115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  34.56 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0624  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79157  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1361  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2470  AraC family transcription regulator  33.85 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0288941  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0600  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1533  putative ethanolamine operon transcriptional regulator  33.08 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.56366  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0947  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0977731  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1205  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1278  AraC family transcription regulator  33.85 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834971  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0344  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.7264  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  33.62 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5506  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 131 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 131 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  30.84 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 131 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0937  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000715  ethanolamine operon regulatory protein  31.13 
 
 		 354 aa  67  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5891  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279127 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3590  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 332 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4473  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4777  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 332 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  31.91 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5221  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3304  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5063  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  32.62 
 
 		 198 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4998  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  37.86 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4684  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.95 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0336  helix-turn-helix domain-containing protein  34.31 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  32.41 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4160  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>