More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3995 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3995  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  657    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  28.42 
 
 		 341 aa  99  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  33.51 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 355 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 355 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 330 aa  89.7  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  41.9 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  42.57 
 
 		 319 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  37.74 
 
 		 327 aa  86.3  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  37.76 
 
 		 198 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  39.23 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.25 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  37.96 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  32.71 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  29.08 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  38.18 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  35.14 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  34.86 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4684  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3159  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  23.91 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4160  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4759  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  26.48 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1113  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.478507 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  34.58 
 
 		 369 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4777  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3590  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  27.54 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5506  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  37.74 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  30.14 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  29.33 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  30.18 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  29.33 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  31.14 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1125  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  29.33 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  20.95 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  28.67 
 
 		 350 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  26.35 
 
 		 350 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.67 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  28.67 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  28.67 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0937  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  28.67 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  28.67 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  26.35 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  26.35 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3824  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347753 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  26.35 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  30.1 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  26.35 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0594  helix-turn-helix domain-containing protein  25.89 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3149  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2565  helix-turn-helix domain-containing protein  35.24 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  28.66 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2689  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>