More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1125 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1125  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  667    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4516  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0629  transcriptional regulator, AraC family  37.69 
 
 		 354 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0639  transcriptional regulator, AraC family  35.65 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  34.89 
 
 		 341 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  36.34 
 
 		 329 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  29.57 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  29.3 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  29.81 
 
 		 321 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  32.55 
 
 		 318 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 392 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 329 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  28.92 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 368 aa  99  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 330 aa  97.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 343 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  47.42 
 
 		 340 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  28.22 
 
 		 369 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 319 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.15 
 
 		 314 aa  86.3  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6280  AraC/XylS family transcription factor  29.85 
 
 		 347 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 334 aa  85.9  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 321 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3159  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2718  transcriptional regulator XylS  30.16 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28.67 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  21.77 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32060  transcriptional regulator XylS  30.28 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2984  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0543899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  41.24 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3100  transcriptional regulator, AraC family  22.98 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4177  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128864  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  38.89 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 362 aa  76.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 		 322 aa  75.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  26.23 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4759  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3995  helix-turn-helix domain-containing protein  38.83 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  26.69 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2689  AraC family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2464  helix-turn-helix, AraC type  27.17 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.903798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  27.27 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  43 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  40.78 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  22.46 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  33.58 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  37.11 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  38.68 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  38.3 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 373 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0570  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5068  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463601  normal  0.326617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000715  ethanolamine operon regulatory protein  30.21 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  36.75 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>