More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32060 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_32060  transcriptional regulator XylS  100 
 
 		 318 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2718  transcriptional regulator XylS  90.88 
 
 		 328 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 335 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 324 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2689  AraC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 318 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3159  AraC family transcriptional regulator  63.52 
 
 		 318 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  63.72 
 
 		 318 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2886  AraC family transcriptional regulator  62.15 
 
 		 318 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  59.25 
 
 		 319 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3100  transcriptional regulator, AraC family  41.64 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  32.48 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  29.3 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  31.8 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 355 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 355 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 355 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0629  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308192  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 341 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 341 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 319 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 319 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 392 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  29.1 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  29.83 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4177  helix-turn-helix domain-containing protein  26.28 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128864  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 330 aa  93.2  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  28.47 
 
 		 369 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 332 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 321 aa  92.4  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 369 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 369 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 369 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  28.4 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0639  transcriptional regulator, AraC family  30.99 
 
 		 350 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  30.04 
 
 		 341 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 334 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 334 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 334 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 389 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  30.67 
 
 		 405 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1125  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  27.05 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  39.42 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  27.42 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  29.87 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000715  ethanolamine operon regulatory protein  43.68 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  28.94 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4759  transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  29.15 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2984  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0543899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0275  DNA-binding helix-turn-helix domain-containing transcriptional regulator protein  27 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  25.69 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  28.15 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1825  AraC family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  38.6 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0570  transcriptional regulator, AraC family  25.08 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4516  AraC family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  26.33 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6280  AraC/XylS family transcription factor  28.01 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3579  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2624  helix-turn-helix domain-containing protein  38.32 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0594  helix-turn-helix domain-containing protein  38.05 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2306  AraC/XylS family transcriptional regulator  38 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  36.03 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  28.11 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0600  AraC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.2 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  27.2 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  27.2 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>