More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0731 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  667    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  72.51 
 
 		 331 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  42.63 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0336  helix-turn-helix domain-containing protein  39.81 
 
 		 317 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4430  AraC family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330528  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4344  AraC family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4724  AraC family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 434 aa  178  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3472  helix-turn-helix domain-containing protein  32.91 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.56499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1227  helix-turn-helix domain-containing protein  33.02 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0166528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1217  helix-turn-helix domain-containing protein  32.69 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1200  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815241  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 131 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 131 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 131 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  50.88 
 
 		 118 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 369 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  27.33 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  38.56 
 
 		 340 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 369 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 369 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 369 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 332 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 		 349 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  32.3 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 352 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  30.73 
 
 		 338 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  35.51 
 
 		 322 aa  86.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  28.26 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  27.19 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  37.24 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6668  transcriptional regulator, AraC family  48.31 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2624  helix-turn-helix domain-containing protein  26.21 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  38.51 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  33.57 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  30.71 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  32.9 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1961  helix-turn-helix domain-containing protein  36.8 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  27.13 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  30.95 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  33.76 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2976  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  26.93 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2718  transcriptional regulator XylS  30.38 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  37.9 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2555  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0150  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2378  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  28.49 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>