282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1200 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1200  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 318 aa  646    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815241  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1227  helix-turn-helix domain-containing protein  98.43 
 
 		 318 aa  634    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0166528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1217  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  646    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  32.69 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  32.33 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4724  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 348 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4344  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 348 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.309673  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4430  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 348 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330528  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0336  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 317 aa  119  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 434 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3472  helix-turn-helix domain-containing protein  31.93 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.56499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  44.95 
 
 		 118 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  28.52 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4177  helix-turn-helix domain-containing protein  24.38 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128864  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  32.19 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  32.71 
 
 		 369 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  32.76 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.29 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  30.28 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5378  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0235204  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  28.77 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  27.2 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6668  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  26.35 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5665  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152948  hitchhiker  0.00312534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3100  transcriptional regulator, AraC family  24.66 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1471  transcriptional regulator, AraC family  26.29 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  35.78 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5882  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 329 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4473  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4998  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  29.26 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  27.88 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  27.88 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0762  regulatory protein HrpB  30.7 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  30.33 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  32.35 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  30.33 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  30.33 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 339 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2188  regulatory protein HrpB  29.57 
 
 		 481 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1621  regulatory protein HrpB  29.57 
 
 		 477 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1966  regulatory protein HrpB  29.57 
 
 		 477 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0645  regulatory protein HrpB  29.57 
 
 		 477 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3360  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  32.35 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5197  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  28.03 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.27 
 
 		 350 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 350 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2270  regulatory protein HrpB  29.57 
 
 		 480 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0667  AraC family transcription regulator  29.57 
 
 		 481 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  27.27 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2624  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 347 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  27.27 
 
 		 350 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>