More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1966 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2188  regulatory protein HrpB  98.96 
 
 		 481 aa  865    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1621  regulatory protein HrpB  100 
 
 		 477 aa  947    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0667  AraC family transcription regulator  98.75 
 
 		 481 aa  863    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0645  regulatory protein HrpB  100 
 
 		 477 aa  947    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0762  regulatory protein HrpB  89.6 
 
 		 478 aa  791    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2270  regulatory protein HrpB  98.54 
 
 		 480 aa  856    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1966  regulatory protein HrpB  100 
 
 		 477 aa  947    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5665  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152948  hitchhiker  0.00312534 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5882  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 477 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5891  AraC family transcriptional regulator  49.58 
 
 		 475 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279127 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1987  hypothetical protein  41.09 
 
 		 483 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1894  hypothetical protein  41.09 
 
 		 483 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0419  hypothetical protein  43.29 
 
 		 475 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.151395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1463  AraC family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 519 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.116991  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0188  AraC family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 519 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1221  AraC family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 519 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0486035  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1111  AraC family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 519 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0464  AraC family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 519 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2606  AraC family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 519 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1376  AraC family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 519 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.510979  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0873  regulatory HRPB transcription regulator protein  37.53 
 
 		 477 aa  280  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31701  normal  0.0121893 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01953  HrpX/HrpB  38.63 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0444  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 468 aa  147  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  36.61 
 
 		 118 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  41.75 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  31.47 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  30.77 
 
 		 350 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  37.96 
 
 		 342 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  30.77 
 
 		 350 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  30.77 
 
 		 350 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 337 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 319 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  30.77 
 
 		 350 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  33.09 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  32.35 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  31.3 
 
 		 350 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.53 
 
 		 350 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 350 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  30.53 
 
 		 350 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  30.53 
 
 		 350 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 302 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  34.29 
 
 		 326 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  30.53 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4772  AraC family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  31.37 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  30.53 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 131 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  41.75 
 
 		 198 aa  65.1  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 131 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 131 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  31.09 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  39.05 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0534  helix-turn-helix domain-containing protein  32.2 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0594  helix-turn-helix domain-containing protein  37 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  33.59 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 335 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 342 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 339 aa  62.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5246  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251899  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 341 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3149  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0150  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2565  helix-turn-helix domain-containing protein  33.06 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3248  HTH-type transcriptional regulator eutR  36.36 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869931  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 330 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 327 aa  59.7  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0963  transcriptional regulator EutR  32 
 
 		 347 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 334 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 337 aa  59.7  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1227  helix-turn-helix domain-containing protein  30.17 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0166528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2706  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 299 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062854  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>