267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0873 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0873  regulatory HRPB transcription regulator protein  100 
 
 		 477 aa  971    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31701  normal  0.0121893 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5665  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 477 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152948  hitchhiker  0.00312534 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5882  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 477 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5891  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 475 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279127 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1621  regulatory protein HrpB  37.53 
 
 		 477 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1966  regulatory protein HrpB  37.53 
 
 		 477 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0645  regulatory protein HrpB  37.53 
 
 		 477 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01953  HrpX/HrpB  39.29 
 
 		 451 aa  263  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2270  regulatory protein HrpB  38.09 
 
 		 480 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2188  regulatory protein HrpB  37.65 
 
 		 481 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0667  AraC family transcription regulator  37.5 
 
 		 481 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0762  regulatory protein HrpB  39.07 
 
 		 478 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1894  hypothetical protein  34.35 
 
 		 483 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1987  hypothetical protein  34.35 
 
 		 483 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0419  hypothetical protein  36.83 
 
 		 475 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.151395  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1221  AraC family transcriptional regulator  33.41 
 
 		 519 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0486035  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1463  AraC family transcriptional regulator  33.41 
 
 		 519 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.116991  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1111  AraC family transcriptional regulator  33.41 
 
 		 519 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0464  AraC family transcriptional regulator  33.41 
 
 		 519 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0188  AraC family transcriptional regulator  33.41 
 
 		 519 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2606  AraC family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 519 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1376  AraC family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 519 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.510979  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0444  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 319 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  37.82 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 338 aa  67  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  29.51 
 
 		 349 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3579  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 319 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  35.45 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  30 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  30 
 
 		 350 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 344 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0600  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 320 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6668  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 324 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  30 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  30 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  29 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  30 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  30 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  29 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  29 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3248  HTH-type transcriptional regulator eutR  30 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  29 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  29 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  30 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3304  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5221  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5063  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0150  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  36.26 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4998  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3995  helix-turn-helix domain-containing protein  28 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 322 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2782  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0613905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000715  ethanolamine operon regulatory protein  24.26 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4473  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  33.72 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1779  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 311 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.255898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 131 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 131 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 131 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4006  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  30.63 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3052  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  30.63 
 
 		 342 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.680184  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 330 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2987  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 342 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0135  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 342 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.935194  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2415  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 328 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.458311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  30.69 
 
 		 118 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  29.86 
 
 		 327 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1227  helix-turn-helix domain-containing protein  25.83 
 
 		 318 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0166528 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3318  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  30.63 
 
 		 342 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1550  ethanolamine operon transcriptional activator EutR  30.63 
 
 		 342 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  23.76 
 
 		 198 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 341 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2624  helix-turn-helix domain-containing protein  31.4 
 
 		 347 aa  55.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  29.91 
 
 		 319 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 329 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>