84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0444 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0444  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 468 aa  928    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303756 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1894  hypothetical protein  32.99 
 
 		 483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1987  hypothetical protein  32.99 
 
 		 483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0419  hypothetical protein  32.99 
 
 		 475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.151395  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5891  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 475 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279127 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0762  regulatory protein HrpB  33.65 
 
 		 478 aa  150  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5665  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 477 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152948  hitchhiker  0.00312534 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01953  HrpX/HrpB  33.57 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5882  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 477 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441461  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1621  regulatory protein HrpB  33.1 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1966  regulatory protein HrpB  33.1 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0645  regulatory protein HrpB  33.1 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0667  AraC family transcription regulator  32.61 
 
 		 481 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2606  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1221  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0486035  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2188  regulatory protein HrpB  32.15 
 
 		 481 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1463  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.116991  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0464  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0188  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1111  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1376  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.510979  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2270  regulatory protein HrpB  33.25 
 
 		 480 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0873  regulatory HRPB transcription regulator protein  30.37 
 
 		 477 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31701  normal  0.0121893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  38.54 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 319 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  36.05 
 
 		 326 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 329 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 328 aa  54.3  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 271 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  37.18 
 
 		 118 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 271 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  37.35 
 
 		 322 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 131 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 131 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 131 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 330 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 368 aa  50.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  28.77 
 
 		 323 aa  50.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  26.67 
 
 		 342 aa  50.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1001  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 324 aa  50.1  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 316 aa  49.7  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 271 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 271 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 271 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 330 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 268 aa  47.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 341 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 352 aa  47  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  47  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 341 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 355 aa  46.6  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 355 aa  46.6  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 341 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1779  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 311 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.255898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  28.07 
 
 		 327 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 352 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  37.88 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  27.03 
 
 		 198 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 373 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6668  transcriptional regulator, AraC family  32.05 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 338 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.93 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 337 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  35.16 
 
 		 319 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0590  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 347 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 277 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 277 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30 
 
 		 299 aa  44.3  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0307  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 338 aa  43.9  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.96292  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 330 aa  43.9  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2090  helix-turn-helix domain-containing protein  35.87 
 
 		 339 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.639887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 355 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  27.06 
 
 		 337 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2464  helix-turn-helix, AraC type  31.58 
 
 		 329 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.903798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 319 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4476  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 314 aa  43.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  30.77 
 
 		 324 aa  43.5  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>