248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0419 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1894  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  965    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0419  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  964    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.151395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1987  hypothetical protein  99.79 
 
 		 483 aa  961    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2606  AraC family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 519 aa  312  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1376  AraC family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 519 aa  312  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.510979  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1221  AraC family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 519 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0486035  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1111  AraC family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 519 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0188  AraC family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 519 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0464  AraC family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 519 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1463  AraC family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 519 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.116991  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0762  regulatory protein HrpB  43.82 
 
 		 478 aa  300  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5665  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 477 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152948  hitchhiker  0.00312534 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5882  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 477 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0667  AraC family transcription regulator  42.69 
 
 		 481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0645  regulatory protein HrpB  42.79 
 
 		 477 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1621  regulatory protein HrpB  42.79 
 
 		 477 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1966  regulatory protein HrpB  42.79 
 
 		 477 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2188  regulatory protein HrpB  42.46 
 
 		 481 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2270  regulatory protein HrpB  42.46 
 
 		 480 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5891  AraC family transcriptional regulator  39.95 
 
 		 475 aa  276  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279127 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0873  regulatory HRPB transcription regulator protein  36.83 
 
 		 477 aa  244  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31701  normal  0.0121893 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01953  HrpX/HrpB  35.2 
 
 		 451 aa  221  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0444  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303756 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  40 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  32.35 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  37.74 
 
 		 434 aa  67  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  35.4 
 
 		 331 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 330 aa  66.6  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  33.03 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  32.67 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  39.81 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  32.67 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  32.67 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.68 
 
 		 350 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 350 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  32.67 
 
 		 350 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  32.67 
 
 		 350 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  32.67 
 
 		 350 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  31.68 
 
 		 350 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  32.67 
 
 		 350 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  31.68 
 
 		 350 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  31.68 
 
 		 350 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  31.68 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  31.68 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  33.02 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0985  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2320  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  29.52 
 
 		 319 aa  57  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 131 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  34.75 
 
 		 323 aa  57  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 131 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 131 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  31.5 
 
 		 349 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  29.84 
 
 		 198 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3159  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 318 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0496338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 302 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3360  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2969  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 324 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 341 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  33.01 
 
 		 319 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5197  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 332 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 302 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 324 aa  54.7  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 337 aa  54.7  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  31.3 
 
 		 118 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  27.62 
 
 		 329 aa  54.3  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 327 aa  54.3  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 327 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  29.85 
 
 		 273 aa  53.9  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 319 aa  53.9  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 373 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  30.1 
 
 		 322 aa  53.5  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 		 333 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.04 
 
 		 338 aa  53.5  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2706  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 299 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062854  normal  0.870196 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>