196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1376 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1221  AraC family transcriptional regulator  99.81 
 
 		 519 aa  1060    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0486035  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2606  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 519 aa  1061    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0188  AraC family transcriptional regulator  99.81 
 
 		 519 aa  1060    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0464  AraC family transcriptional regulator  99.81 
 
 		 519 aa  1060    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1463  AraC family transcriptional regulator  99.81 
 
 		 519 aa  1060    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.116991  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1376  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 519 aa  1061    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.510979  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1111  AraC family transcriptional regulator  99.81 
 
 		 519 aa  1060    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1987  hypothetical protein  39.36 
 
 		 483 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1894  hypothetical protein  39.16 
 
 		 483 aa  320  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0419  hypothetical protein  40.72 
 
 		 475 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.151395  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5665  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 477 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152948  hitchhiker  0.00312534 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5882  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 477 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5891  AraC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 475 aa  282  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279127 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0762  regulatory protein HrpB  39.59 
 
 		 478 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1621  regulatory protein HrpB  39.55 
 
 		 477 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1966  regulatory protein HrpB  39.55 
 
 		 477 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0645  regulatory protein HrpB  39.55 
 
 		 477 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2188  regulatory protein HrpB  39.23 
 
 		 481 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0667  AraC family transcription regulator  39.23 
 
 		 481 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2270  regulatory protein HrpB  39.02 
 
 		 480 aa  273  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01953  HrpX/HrpB  36.68 
 
 		 451 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0873  regulatory HRPB transcription regulator protein  33.18 
 
 		 477 aa  219  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31701  normal  0.0121893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0444  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303756 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  37.27 
 
 		 342 aa  67  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  35.96 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  36.44 
 
 		 326 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 330 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  31.46 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2227  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 131 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.259057  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2273  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 131 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2216  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 131 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6668  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 352 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1533  helix-turn-helix domain-containing protein  29.46 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  31.43 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  32.48 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4772  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  33.62 
 
 		 323 aa  57  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0105  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 319 aa  56.6  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 373 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2984  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 336 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0543899 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 341 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  29.31 
 
 		 198 aa  54.3  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 362 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 355 aa  53.9  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2201  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 		 335 aa  53.5  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3995  helix-turn-helix domain-containing protein  26.55 
 
 		 318 aa  53.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 344 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5068  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 324 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463601  normal  0.326617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  26.15 
 
 		 340 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 		 322 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 319 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5246  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251899  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 327 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 341 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 340 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  28.44 
 
 		 329 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 329 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 434 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 341 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 316 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 321 aa  51.6  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 351 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 351 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  26.75 
 
 		 338 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 302 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  28.85 
 
 		 350 aa  51.2  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  30.08 
 
 		 350 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3248  HTH-type transcriptional regulator eutR  32.18 
 
 		 342 aa  51.2  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869931  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  30.08 
 
 		 350 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  29.81 
 
 		 350 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  30.08 
 
 		 350 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1672  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 332 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.17554  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.85 
 
 		 350 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 350 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  30.08 
 
 		 350 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1694  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 369 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1722  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 369 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1738  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 369 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  28.85 
 
 		 350 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  28.85 
 
 		 350 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  28.85 
 
 		 350 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 334 aa  50.8  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3360  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 334 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 344 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.33 
 
 		 314 aa  50.8  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 343 aa  50.4  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5197  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 332 aa  50.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0336  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 317 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 344 aa  50.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 339 aa  50.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  28.85 
 
 		 350 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  28.85 
 
 		 350 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  27.68 
 
 		 358 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>