288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5891 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5891  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 475 aa  958    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279127 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5665  AraC family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 477 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152948  hitchhiker  0.00312534 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5882  AraC family transcriptional regulator  50.1 
 
 		 477 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.441461  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1621  regulatory protein HrpB  48.95 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1966  regulatory protein HrpB  48.95 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0645  regulatory protein HrpB  48.95 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0667  AraC family transcription regulator  48.02 
 
 		 481 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2270  regulatory protein HrpB  48.44 
 
 		 480 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0762  regulatory protein HrpB  47.29 
 
 		 478 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2188  regulatory protein HrpB  47.82 
 
 		 481 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1894  hypothetical protein  38.11 
 
 		 483 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1987  hypothetical protein  38.11 
 
 		 483 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1221  AraC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 519 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0486035  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1111  AraC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 519 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0464  AraC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 519 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1463  AraC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 519 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.116991  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0188  AraC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 519 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2606  AraC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 519 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1376  AraC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 519 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.510979  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0419  hypothetical protein  37.92 
 
 		 475 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.151395  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0873  regulatory HRPB transcription regulator protein  36.33 
 
 		 477 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.31701  normal  0.0121893 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01953  HrpX/HrpB  37.02 
 
 		 451 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0444  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 468 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  39.23 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  30.6 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  34.48 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  36.51 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3316  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 344 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 352 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0722  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564708 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  35.94 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  34.51 
 
 		 118 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2919  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0136  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3149  AraC family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 349 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2565  helix-turn-helix domain-containing protein  44.32 
 
 		 299 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0594  helix-turn-helix domain-containing protein  37 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2706  AraC family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062854  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0136  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0126  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0150  AraC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2896  AraC family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 302 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.311951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  35.04 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3995  helix-turn-helix domain-containing protein  28.24 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  34.4 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  37.93 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  32.17 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5246  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251899  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2809  transcriptional regulator EutR  33.6 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.17 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  32.17 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  32.17 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  33.6 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  32.17 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2827  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 302 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  33.6 
 
 		 350 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  33.6 
 
 		 350 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  33.6 
 
 		 350 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  33.6 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  33.6 
 
 		 350 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0134  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 343 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393032  normal  0.761284 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 327 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  36.11 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2757  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.968355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  32.8 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3517  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0011  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0768217 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0540  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4440  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6668  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4317  transcriptional regulator, AraC family  35.43 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  34.43 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 327 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  34.34 
 
 		 324 aa  59.7  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 329 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3248  HTH-type transcriptional regulator eutR  36.46 
 
 		 342 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869931  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0545  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 339 aa  59.7  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.042233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0025  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 349 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>