More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3517 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3517  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 305 aa  580  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0675  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 324 aa  99.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2800  hypothetical protein  33.98 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  26.33 
 
 		 333 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  30.52 
 
 		 791 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  25.42 
 
 		 324 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.17 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.21 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  25.33 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 791 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  27.92 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  23.25 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  27.66 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  27.44 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 791 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 777 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  25.72 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  29.58 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1604  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 354 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 844 aa  66.6  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5309  AraC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0311783  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1154  AraC family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569492  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1058  AraC family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  24.41 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  24.41 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.41 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.41 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  28.67 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0150  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  24.07 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  29.88 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.24 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  26.92 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.91 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.07 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  29.88 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2090  helix-turn-helix domain-containing protein  39.05 
 
 		 339 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.639887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0512  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  29.84 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.383418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1711  AraC family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.311162  normal  0.0412412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4009  helix-turn-helix domain-containing protein  36.52 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125602  normal  0.35131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 810 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0131  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5891  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0237  transcriptional regulator, AraC family  26.56 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4320  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4458  transcriptional regulator, AraC family  27.05 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00884299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.91 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  22.79 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1968  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0488  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>