More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3662 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 324 aa  661    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 336 aa  291  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 330 aa  286  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 389 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0675  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  31.97 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 791 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 346 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 346 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 346 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  29.84 
 
 		 791 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 352 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  29.07 
 
 		 791 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 777 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  24.6 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  26.86 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 318 aa  109  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.77 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.48 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.48 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  28.48 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  29.73 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  26.9 
 
 		 340 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.48 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  29.15 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  25.5 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  28.43 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.48 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 844 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3517  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 305 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 382 aa  99.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  31.75 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.62 
 
 		 304 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  30.08 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  28.14 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0488  AraC family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 186 aa  94  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 325 aa  92.8  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 318 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 332 aa  90.5  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 338 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1779  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 311 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.255898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  27.1 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  26.02 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.71 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  27.08 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.23 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 319 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4320  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  34.53 
 
 		 319 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  34.53 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 356 aa  87  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  34.53 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  29.1 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2090  helix-turn-helix domain-containing protein  32.38 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.639887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  29.03 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.383418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 332 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>