More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5093 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 319 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  58.33 
 
 		 340 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  27.07 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  27.07 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  27.07 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 318 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 318 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 318 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  29.02 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  25.8 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 318 aa  122  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  27.04 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  28.08 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 327 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  28.62 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  24.5 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  28.21 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3807  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.13417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 319 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  28.14 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  29.34 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  28.75 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 347 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 352 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  26.25 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 339 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 368 aa  93.6  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 337 aa  93.6  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 346 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 346 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 346 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  23.89 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1512  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2046  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 326 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  25.47 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 777 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5309  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0311783  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.26 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4500  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.85 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2287  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0383209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0675  transcriptional regulator, AraC family  28.88 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0534  transcriptional regulator, AraC family  30.17 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3660  AraC family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.954099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2626  transcriptional regulator, AraC family  25.27 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000849178  hitchhiker  0.00271101 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  25.08 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 844 aa  79.7  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  26.93 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0131  transcriptional regulator, AraC family  31.12 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  22.81 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.09 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  28.42 
 
 		 791 aa  73.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.75 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0150  AraC family transcriptional regulator  21.75 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3102  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  21.07 
 
 		 356 aa  72.4  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  29.64 
 
 		 292 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 382 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  25.47 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2978  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  21.07 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  26.04 
 
 		 791 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1695  transcriptional regulator, AraC family  23.75 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>