More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2287 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2287  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 346 aa  697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0383209 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  30.06 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  30.06 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5609  AraC family transcriptional regulator  61.17 
 
 		 171 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  28.88 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  28.32 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 391 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  26.1 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 354 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  25.08 
 
 		 352 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0234  transcriptional regulator, AraC family  29.56 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0237  transcriptional regulator, AraC family  26.15 
 
 		 331 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 351 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 356 aa  89.7  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 356 aa  89.7  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4409  helix-turn-helix domain-containing protein  25.6 
 
 		 386 aa  89.4  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  26 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 350 aa  85.9  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4055  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  26.65 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0512  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  25.11 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  27.66 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2016  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875344  normal  0.643509 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25.3 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  26.26 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  27.11 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 777 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  26.76 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0584  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  32.81 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2978  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 318 aa  67  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 324 aa  67  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0853  AraC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  23.58 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  22.44 
 
 		 311 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  26.45 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  24.14 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  22.68 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  23.55 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  24.77 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  33.59 
 
 		 791 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 791 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  26.18 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  22.54 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 791 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  35.58 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  36.63 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  22.74 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  38.24 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 136 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  33.04 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  33.04 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  33.04 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>