More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0584 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0584  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 351 aa  687    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  81.63 
 
 		 334 aa  541  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  81.33 
 
 		 334 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 338 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  32.36 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4055  AraC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  26.58 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 344 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 391 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2016  helix-turn-helix, AraC type  33.46 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  34.07 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 340 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  28.15 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 352 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 350 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2585  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  0.493972 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 356 aa  89.4  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 317 aa  88.6  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  30.07 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0512  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  29.61 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  29.94 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  26.73 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  26.87 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  29.2 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  36.22 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2287  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0383209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  28.01 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0237  transcriptional regulator, AraC family  26.81 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  36.46 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  27.61 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  27.57 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  27.57 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5039  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2366  transcriptional regulator, AraC family  26.24 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  29.05 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.11 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0234  transcriptional regulator, AraC family  30.14 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.99 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.83 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2626  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000849178  hitchhiker  0.00271101 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.83 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.83 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  28.83 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  25.94 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  27.42 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 777 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 318 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 318 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.83 
 
 		 301 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  35.96 
 
 		 791 aa  67  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 318 aa  67  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  28.83 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  27.42 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  27.76 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  34.76 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0294  putative transcription regulator protein  25.9 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.785929  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>