More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5039 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5039  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 333 aa  663    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  39.51 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2366  transcriptional regulator, AraC family  38.62 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  41.47 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2016  helix-turn-helix, AraC type  36.75 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 352 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2585  AraC family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  0.493972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 382 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 350 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  27.85 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 382 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 344 aa  95.9  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 350 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 352 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 344 aa  94  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2626  transcriptional regulator, AraC family  25.22 
 
 		 336 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000849178  hitchhiker  0.00271101 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  28.22 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 391 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  29.48 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  27.81 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  27.81 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  32.04 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  41.67 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4055  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 325 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0584  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  41.05 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4409  helix-turn-helix domain-containing protein  24.77 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  23.87 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1604  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1517  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000450911  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0556  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0696213  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  25.61 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2088  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0770  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2058  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0853  AraC family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  26.54 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  37.89 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0488  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 186 aa  62  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2148  AraC-type DNA-binding domain-containing proteins  28.4 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5309  AraC family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0311783  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  42.22 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  32.23 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3807  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.13417 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 268 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  35.05 
 
 		 791 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 777 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4500  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  36.44 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  38.04 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  36.17 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  38.78 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 319 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>