More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0550 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 356 aa  739    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  99.72 
 
 		 356 aa  736    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  54.49 
 
 		 350 aa  358  9e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 332 aa  325  6e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 318 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 391 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  30.17 
 
 		 338 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  30.17 
 
 		 338 aa  133  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  28.3 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0237  transcriptional regulator, AraC family  30.92 
 
 		 331 aa  122  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0234  transcriptional regulator, AraC family  28.44 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  29.64 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0512  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  26.99 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  26.99 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2016  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 375 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875344  normal  0.643509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2978  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 313 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  25.91 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 320 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2287  AraC family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 346 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0383209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 		 380 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  27.21 
 
 		 382 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 350 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4409  helix-turn-helix domain-containing protein  26.33 
 
 		 386 aa  85.9  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  26.49 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2366  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  26.21 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  23.13 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.35 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0584  transcriptional regulator, AraC family  26.15 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2585  AraC family transcriptional regulator  21.22 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  0.493972 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  25.77 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  25.77 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.77 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5309  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0311783  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.77 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  25.77 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.77 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  23.3 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  25.19 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 791 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.81 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  34.52 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  21.07 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  22.98 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  24.68 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.41 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2016  helix-turn-helix, AraC type  25.09 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  24.46 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4055  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  24.56 
 
 		 791 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  27.82 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.68 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0294  putative transcription regulator protein  30.24 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.785929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 777 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  23.99 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2046  AraC family transcriptional regulator  23.34 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2626  transcriptional regulator, AraC family  24.32 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000849178  hitchhiker  0.00271101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  24.22 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2148  AraC-type DNA-binding domain-containing proteins  34.59 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3807  AraC family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.13417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>