More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4851 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 322 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3807  AraC family transcriptional regulator  52.09 
 
 		 325 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.13417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1512  AraC family transcriptional regulator  49.2 
 
 		 324 aa  275  8e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  31.44 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  27.59 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  29.19 
 
 		 353 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 342 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  28.01 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  26.18 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  28.19 
 
 		 333 aa  99.4  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 326 aa  99.4  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  27.5 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 319 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  24.53 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 389 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  27.8 
 
 		 340 aa  92.8  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 324 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 327 aa  91.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 338 aa  89  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  26.21 
 
 		 382 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.1 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1604  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6006  hypothetical protein  35.17 
 
 		 145 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.874649  normal  0.063736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.16 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  24.92 
 
 		 380 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  26.01 
 
 		 319 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 340 aa  85.9  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 319 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  25.71 
 
 		 319 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 318 aa  85.9  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 318 aa  85.9  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 318 aa  85.9  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 777 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  29.08 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0534  transcriptional regulator, AraC family  31.47 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  24.04 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2978  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  24.04 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  25.61 
 
 		 791 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  26.44 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  23.62 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.16 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  25.76 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  24.54 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 791 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  24.54 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.54 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.55 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  25.97 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>