More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7818 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 342 aa  696    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  50.63 
 
 		 353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 298 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 319 aa  205  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40.94 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.383418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  36.16 
 
 		 321 aa  182  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  29.75 
 
 		 324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3807  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 325 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.13417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  31.03 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 347 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 327 aa  122  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  29.78 
 
 		 340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  31.33 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  41.27 
 
 		 791 aa  112  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 324 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  28.09 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1512  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  28.71 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  33.1 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 791 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  28.34 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0534  transcriptional regulator, AraC family  31.2 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 319 aa  99.8  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1604  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.04 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  28.2 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 791 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 337 aa  97.8  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 321 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25.17 
 
 		 288 aa  96.3  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  30.2 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2090  helix-turn-helix domain-containing protein  32.76 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.639887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 319 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  28.42 
 
 		 319 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  28.47 
 
 		 319 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 777 aa  92.8  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  28.83 
 
 		 334 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  29.03 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 335 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.12 
 
 		 342 aa  90.1  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  26.99 
 
 		 318 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 350 aa  89.4  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1779  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 311 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.255898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.2 
 
 		 314 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  26.1 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 318 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  28.53 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.46 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 350 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.11 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>