More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2706 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 354 aa  723    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 382 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  33.63 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  33.63 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  29.29 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 344 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 351 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  30.62 
 
 		 350 aa  139  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2366  transcriptional regulator, AraC family  31.35 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  32.83 
 
 		 309 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  27.99 
 
 		 382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0512  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 343 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0234  transcriptional regulator, AraC family  31.02 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 332 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0237  transcriptional regulator, AraC family  31.17 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 		 340 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2585  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  0.493972 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  28.8 
 
 		 380 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2626  transcriptional regulator, AraC family  28.53 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000849178  hitchhiker  0.00271101 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 350 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2016  helix-turn-helix, AraC type  30.59 
 
 		 337 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  26.81 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  28.67 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.56 
 
 		 316 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  26.2 
 
 		 311 aa  103  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  31.06 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2287  AraC family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 346 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0383209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4409  helix-turn-helix domain-containing protein  27.63 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0584  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 329 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  27.74 
 
 		 348 aa  99.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4055  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 279 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  32.17 
 
 		 320 aa  96.7  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  31.28 
 
 		 333 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 342 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25.29 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3807  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 325 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.13417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.69 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2978  AraC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  28.23 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2016  AraC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 375 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875344  normal  0.643509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  29.96 
 
 		 791 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  28.09 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 777 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  26.35 
 
 		 791 aa  87.8  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  25.72 
 
 		 324 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 791 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1512  AraC family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  27.88 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.25 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0131  transcriptional regulator, AraC family  30.2 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  28.34 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  26.8 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5609  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 171 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  25.49 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>