More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4231 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 351 aa  708    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0512  AraC family transcriptional regulator  61.01 
 
 		 343 aa  381  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  45.54 
 
 		 335 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0237  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0234  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 354 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2016  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 375 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875344  normal  0.643509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  32.19 
 
 		 344 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 391 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  28.91 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  27.67 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  27.02 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 352 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4409  helix-turn-helix domain-containing protein  27.06 
 
 		 386 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  27.71 
 
 		 382 aa  99.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 318 aa  96.7  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 373 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 373 aa  91.3  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2287  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 346 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0383209 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  25.7 
 
 		 380 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2366  transcriptional regulator, AraC family  27.81 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  27.37 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  30.29 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4055  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  27.53 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2585  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  0.493972 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2016  helix-turn-helix, AraC type  29.51 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  28.83 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  28.83 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  26.69 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.04 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.04 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  26.04 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.04 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.04 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0294  putative transcription regulator protein  25.09 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.785929  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.59 
 
 		 342 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2978  AraC family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2626  transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000849178  hitchhiker  0.00271101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.66 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5309  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0311783  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  38.32 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 315 aa  67  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  30.05 
 
 		 317 aa  67  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  37.37 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  27.54 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0584  transcriptional regulator, AraC family  29.5 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  27.54 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  27.54 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0131  transcriptional regulator, AraC family  26.26 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  34.58 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  23.45 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  31.78 
 
 		 1388 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5609  AraC family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  34.91 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1154  AraC family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569492  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  37.25 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  24.29 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1058  AraC family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  43.43 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>