More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0051 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  99.69 
 
 
318 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
319 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  100 
 
 
319 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  99.37 
 
 
319 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  100 
 
 
319 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  99.69 
 
 
318 aa  651    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  99.69 
 
 
318 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  96.2 
 
 
319 aa  599  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 
316 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  30.09 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 
329 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 
346 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 
346 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 
346 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  32.24 
 
 
314 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  27.12 
 
 
347 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 
319 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  26.78 
 
 
352 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  38.02 
 
 
330 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 
319 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  29.11 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  27.36 
 
 
324 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 
318 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  28.76 
 
 
321 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 
327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 
326 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5309  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 
314 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0311783  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  35.95 
 
 
389 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  30.22 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  27.97 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 
326 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 
326 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 
326 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 
330 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 
339 aa  113  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 
791 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 
321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 
326 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  28.97 
 
 
313 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  29.71 
 
 
791 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  27.7 
 
 
305 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  23.84 
 
 
333 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  29.47 
 
 
316 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 
327 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  29.53 
 
 
311 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  27.7 
 
 
332 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
336 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  29.97 
 
 
316 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 
367 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
317 aa  99  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4500  AraC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
323 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2046  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  29.34 
 
 
791 aa  99  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  25.65 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 
368 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25 
 
 
288 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0534  transcriptional regulator, AraC family  30.64 
 
 
261 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.11 
 
 
304 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  30.05 
 
 
368 aa  96.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1512  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
324 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  40.29 
 
 
319 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 
305 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 
350 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  39.69 
 
 
316 aa  93.2  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0697858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.04 
 
 
301 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.04 
 
 
301 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.04 
 
 
301 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  30.04 
 
 
301 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.04 
 
 
301 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  30.04 
 
 
301 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 
328 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  31.43 
 
 
314 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 
322 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 
316 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 
344 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.68 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 
777 aa  89.4  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3807  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 
325 aa  89  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.13417 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
312 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.45 
 
 
342 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
342 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 
338 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1604  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 
354 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1695  transcriptional regulator, AraC family  26.11 
 
 
324 aa  85.9  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 
340 aa  85.9  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.62 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4055  AraC family transcriptional regulator  28.34 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  28.32 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  22.86 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  19.87 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>