More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3881 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 335 aa  682    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0512  AraC family transcriptional regulator  46.06 
 
 		 343 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0237  transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 		 331 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0234  transcriptional regulator, AraC family  31.74 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  33.43 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  32.73 
 
 		 344 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2016  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 375 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875344  normal  0.643509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  28.52 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 382 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  29.43 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 356 aa  109  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 356 aa  110  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 332 aa  105  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  27.65 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  26.62 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 350 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 350 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 350 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2366  transcriptional regulator, AraC family  29.62 
 
 		 335 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 352 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  27.42 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2585  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 339 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  0.493972 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 350 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  29.55 
 
 		 309 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2016  helix-turn-helix, AraC type  26.79 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2978  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0294  putative transcription regulator protein  25.32 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.785929  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4055  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  28.16 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  24.17 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0584  transcriptional regulator, AraC family  30.21 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2626  transcriptional regulator, AraC family  25.98 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000849178  hitchhiker  0.00271101 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2287  AraC family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0383209 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.49 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4409  helix-turn-helix domain-containing protein  24.23 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  31.6 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0853  AraC family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  38.95 
 
 		 1370 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  24.41 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  29.15 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.03 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  41.41 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  30.84 
 
 		 1374 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5039  AraC family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 777 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  32.14 
 
 		 1366 aa  63.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 1349 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.37 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  35.64 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  31.9 
 
 		 1378 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.22 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  35.24 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1947  two component transcriptional regulator, AraC family  30.16 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.272912 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1517  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000450911  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2058  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0770  AraC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>