More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0294 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0294  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 352 aa  728    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.785929  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 344 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 350 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  26.16 
 
 		 382 aa  93.2  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 382 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4055  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 311 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  26.16 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  25.32 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  29.26 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  27.24 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  38.14 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0853  AraC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  27.52 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  27.52 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  27.52 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2366  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  25.46 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  29.66 
 
 		 1347 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2016  helix-turn-helix, AraC type  25.8 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.48 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.48 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.48 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  26.48 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.48 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  25.73 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  25.73 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  29.69 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0234  transcriptional regulator, AraC family  25.17 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  33.67 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4409  helix-turn-helix domain-containing protein  32.69 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1517  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000450911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.56 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0556  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0696213  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2148  AraC-type DNA-binding domain-containing proteins  40.21 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0770  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2058  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2088  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  27.16 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  29.59 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 777 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  31.48 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0512  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  32.48 
 
 		 1344 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  27.61 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  25.62 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2755  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1604  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>