More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1569 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  99.67 
 
 		 301 aa  628  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  100 
 
 		 301 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  99.34 
 
 		 301 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  99.67 
 
 		 301 aa  627  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  99.34 
 
 		 301 aa  625  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  99.34 
 
 		 301 aa  625  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  48.97 
 
 		 302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  44.04 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.1 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.16 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.71 
 
 		 316 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1154  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569492  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1058  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4458  transcriptional regulator, AraC family  27.12 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00884299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  26.76 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 329 aa  105  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  25.95 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  27.24 
 
 		 320 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 330 aa  99.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 346 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 346 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 346 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  25.6 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  23.36 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 352 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  25.91 
 
 		 324 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 347 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 368 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  27.82 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  24.82 
 
 		 311 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  30.2 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 352 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 389 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  30.2 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 319 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 316 aa  85.5  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0534  transcriptional regulator, AraC family  27.38 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0675  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  25.63 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 354 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  25.36 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0488  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 186 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2585  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  0.493972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3134  helix-turn-helix domain-containing protein  22.67 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2016  helix-turn-helix, AraC type  26.25 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  27.72 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  27.72 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1779  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.255898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  25.09 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  25.18 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 791 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  23.93 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  24.82 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3807  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.13417 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0853  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  25.82 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  32.04 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2090  helix-turn-helix domain-containing protein  33.59 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.639887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  22.76 
 
 		 791 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  22.85 
 
 		 777 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  23.15 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  23.15 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  23.55 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>