More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0608 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  99.4 
 
 		 334 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 334 aa  664    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0584  transcriptional regulator, AraC family  81.33 
 
 		 351 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 382 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4055  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2016  helix-turn-helix, AraC type  33.33 
 
 		 337 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  27.54 
 
 		 380 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 344 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 356 aa  99  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 		 352 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  24.5 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  30.87 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 352 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2585  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 339 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  0.493972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  28.09 
 
 		 309 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2366  transcriptional regulator, AraC family  27.85 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0237  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 331 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  33.98 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0512  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  27.65 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  33.74 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  26.88 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.4 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  27.31 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5039  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.72 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.72 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.72 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  27.72 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.72 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2287  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0383209 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  27.72 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.74 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 777 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  26.5 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0234  transcriptional regulator, AraC family  28.75 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2626  transcriptional regulator, AraC family  27.17 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000849178  hitchhiker  0.00271101 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  27.92 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  25.24 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  26.58 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  35.96 
 
 		 791 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  27.65 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2016  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875344  normal  0.643509 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0294  putative transcription regulator protein  25.73 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.785929  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  24.92 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  24.92 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  28.07 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.7 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>