226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2626 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2626  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 336 aa  681    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000849178  hitchhiker  0.00271101 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  26.4 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  26.78 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 391 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5039  AraC family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 333 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2366  transcriptional regulator, AraC family  26.22 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2585  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  0.493972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  25.79 
 
 		 352 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 340 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0237  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2016  helix-turn-helix, AraC type  26.09 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0234  transcriptional regulator, AraC family  25.77 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  25.37 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  26.13 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4409  helix-turn-helix domain-containing protein  24.18 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  25.98 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  26.1 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  23.76 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  26.79 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  24.84 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  27.17 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  27.17 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  23.1 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0512  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  26.95 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  23.84 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0584  transcriptional regulator, AraC family  34.68 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  24.6 
 
 		 791 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  32.09 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2016  AraC family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875344  normal  0.643509 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 791 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 315 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.64 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  23.22 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  25.9 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.383418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  38.37 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2148  AraC-type DNA-binding domain-containing proteins  37.89 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2090  helix-turn-helix domain-containing protein  37 
 
 		 339 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.639887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2088  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2058  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0770  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 777 aa  56.2  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1517  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000450911  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0556  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0696213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>