More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1517 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2058  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 330 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1517  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 353 aa  708    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000450911  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0556  AraC family transcriptional regulator  99.43 
 
 		 373 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0696213  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0770  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 330 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2148  AraC-type DNA-binding domain-containing proteins  99.39 
 
 		 351 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2088  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 330 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0853  AraC family transcriptional regulator  87.11 
 
 		 395 aa  600  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  29.48 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  27.04 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  26.27 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  26.46 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  27.57 
 
 		 344 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5039  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0488  AraC family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 186 aa  67  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 326 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 326 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 326 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0294  putative transcription regulator protein  27.54 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.785929  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  34.69 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.87 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  27.46 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.87 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  27.87 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.87 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.87 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4500  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2287  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0383209 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  23.46 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2978  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  31.01 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  37.89 
 
 		 318 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  25.46 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  35.35 
 
 		 1370 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3203  transcriptional regulator  37.4 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3942  AraC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  27.94 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  36.69 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.32 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  37.62 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  34.69 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  34.82 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2824  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.60964 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2418  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 777 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  29.96 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  36.63 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0347  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4605  two component transcriptional regulator, AraC family  38.98 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>