More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5148 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  55.33 
 
 		 791 aa  872    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  89.89 
 
 		 791 aa  1457    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  50.44 
 
 		 777 aa  768    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 791 aa  1617    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  50.8 
 
 		 810 aa  742    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 844 aa  728    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  64.72 
 
 		 485 aa  617  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  65.57 
 
 		 491 aa  606  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  63.64 
 
 		 483 aa  593  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  64.73 
 
 		 481 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  63.08 
 
 		 479 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  63.15 
 
 		 479 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  61.92 
 
 		 479 aa  567  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  60.87 
 
 		 413 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  36.29 
 
 		 775 aa  298  2e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  37.82 
 
 		 359 aa  258  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  40.83 
 
 		 389 aa  256  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  37.26 
 
 		 345 aa  246  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  37.62 
 
 		 358 aa  244  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 316 aa  244  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  36.39 
 
 		 343 aa  228  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  36.52 
 
 		 343 aa  226  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  31.33 
 
 		 324 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  33.57 
 
 		 318 aa  160  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  28.78 
 
 		 347 aa  150  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  30.38 
 
 		 373 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  30.86 
 
 		 454 aa  148  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  31.1 
 
 		 313 aa  147  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  31.03 
 
 		 315 aa  146  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  29.74 
 
 		 456 aa  143  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  29.65 
 
 		 416 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  29.42 
 
 		 416 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  29.42 
 
 		 416 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 329 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  27.49 
 
 		 438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 347 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  26.84 
 
 		 379 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  27.25 
 
 		 438 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 352 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  29.71 
 
 		 320 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  29.26 
 
 		 316 aa  129  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 346 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 346 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 346 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  33.13 
 
 		 418 aa  127  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 324 aa  126  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  27.95 
 
 		 312 aa  124  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  28.74 
 
 		 315 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  26.46 
 
 		 321 aa  119  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  33.61 
 
 		 330 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  26.7 
 
 		 439 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  26 
 
 		 321 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  26.29 
 
 		 316 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  27.64 
 
 		 484 aa  112  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 319 aa  112  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  29.88 
 
 		 320 aa  111  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  27.86 
 
 		 324 aa  110  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  27.68 
 
 		 322 aa  109  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  29.52 
 
 		 363 aa  107  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  28.61 
 
 		 318 aa  107  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  30.46 
 
 		 328 aa  104  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  27.01 
 
 		 360 aa  102  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  30.96 
 
 		 319 aa  101  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  30.96 
 
 		 319 aa  101  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 318 aa  101  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 319 aa  101  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  29.26 
 
 		 412 aa  100  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 318 aa  101  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 318 aa  101  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  30.96 
 
 		 319 aa  101  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 319 aa  100  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  29.04 
 
 		 479 aa  100  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 336 aa  100  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  29.84 
 
 		 288 aa  100  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  28.35 
 
 		 337 aa  99.4  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  33 
 
 		 381 aa  98.2  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 318 aa  97.4  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  28.44 
 
 		 305 aa  97.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  33.66 
 
 		 312 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  27.31 
 
 		 315 aa  96.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  27.86 
 
 		 313 aa  95.9  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  26.51 
 
 		 498 aa  95.9  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 298 aa  95.9  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 327 aa  95.5  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  29.92 
 
 		 321 aa  94.7  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  32.67 
 
 		 312 aa  94.4  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 312 aa  93.6  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.24 
 
 		 342 aa  93.2  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  32.14 
 
 		 340 aa  93.2  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 317 aa  91.7  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 330 aa  91.3  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 318 aa  91.3  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 339 aa  91.3  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 324 aa  90.5  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 330 aa  90.1  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  25.57 
 
 		 305 aa  89.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  34 
 
 		 319 aa  89.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  31.19 
 
 		 314 aa  89.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  34 
 
 		 319 aa  89.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  34 
 
 		 319 aa  89.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>