More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0234 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0234  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 331 aa  676    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0237  transcriptional regulator, AraC family  53.85 
 
 		 331 aa  349  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2016  AraC family transcriptional regulator  40.92 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.875344  normal  0.643509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  31.74 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0512  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  31.42 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2978  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5602  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 391 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455635  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  29.2 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5888  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  26.77 
 
 		 350 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0127  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4409  helix-turn-helix domain-containing protein  28.9 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0481  AraC family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 373 aa  95.9  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974899  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0550  AraC family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 373 aa  95.9  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  25.26 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  25.26 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2287  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 346 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0383209 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3674  helix-turn-helix domain-containing protein  27.12 
 
 		 382 aa  93.6  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.833381  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0210  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 382 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.278356  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  27.63 
 
 		 352 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4632  transcriptional regulator, AraC family  42.59 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5238  helix-turn-helix domain-containing protein  34.84 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4875  AraC family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0955854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2626  transcriptional regulator, AraC family  25.77 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000849178  hitchhiker  0.00271101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  28.51 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2585  AraC family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  0.493972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4055  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.1 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  29.1 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  29.1 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.68 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  29.1 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  28.69 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  28.75 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.69 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  28.75 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1049  transcriptional regulator, AraC family  31.98 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  25.2 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2366  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0294  putative transcription regulator protein  25.17 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.785929  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  28.39 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  25.27 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  24.21 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2016  helix-turn-helix, AraC type  26.17 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  25.27 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  25.27 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  26.29 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0584  transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.458735  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  30.77 
 
 		 1347 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  33.99 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.34 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1604  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3517  transcriptional regulator, AraC family  26.36 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.14 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  33.33 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6267  transcriptional regulator  27.89 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  26.48 
 
 		 321 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  25.2 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  28.85 
 
 		 1376 aa  56.6  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5609  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  23.51 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>